Bad Apple es una manzana malvada que cobró vida debido a los restos de la magia de Nightmare Moon y el antagonista principal del doceavo arco de los cómics: Night of the Living Apples.
Descripción en los cómics[]
Hace mil años, cuando la Princesa Celestia había desterrado de la Nightmare Moon a la luna, los restos de sus meteoritos de batalla contaminados por su magia quedan a la deriva por el espacio. Mil años más tarde, los meteoritos caen a la tierra y y aterrizan fuera de Sweet Apple Acres en el medio de la noche. Cuando Applejack va a investigar, se da cuenta de que las manzanas caen de los árboles antes de lo que se espera. Las manzanas, afectadas por la magia de los meteoritos, de repente cobran vida y van en enjambre sobre Applejack.
Al día siguiente las Mane 6, Spike, Sweetie Belle y Scootaloo van a Sweet Apple Acres a ver a Applejack, se encentan a un ejercito de manzanas apoderándose de todo el lugar y teniendo presos a la familia Apple. Bad Apple aparece cuando ellas intentan huir y Rainbow Dash es la única que lo logra, él trae una catapulta para poder lanzare manzanas derribandola y atrapándola también. Ahí mismo anuncia su plan de conquista a Ponyville y su ideología como gobernador.
Esa misma noche Bad Apple y su ejercito de manzanas invaden Ponyville y logran conquistarlo sin problemas. Las manzanas atrapan a la Alcaldesa y Bad Apple le aclara los términos de su nuevo gobierno, obligandola a juran que ninguna manzana sera atacada.
Cuando las Mane 6 se llegan a transformar en murciélagos de fruta para atacar y devorar a las manzanas, Bad Apple ordena la retirada del ejercito. Pero en ello todas las manzanas se juntan para formar un gigantesco monstruo (que era idéntico a Spike).
Spike sugiere cambian el núcleo de Bad Apple por él de Good Apple, por lo tanto Rainbow lo toma y atraviesa el monstruo combinándolo por el lugar de Bad Apple y Good Apple hace que todas las manzanas tengan buenos pensamientos haciendo que se reformen.
Al día siguiente la Princesa Celestia y la Princesa Luna llevan a todas las manzanas a un lugar donde puedan formar su hogar, y entre todos ellos llevan a Bad Apple enjaulado.